1.功能核酸表征平台：
建立针对分子、病毒颗粒、活细胞、微生物、血清、组织切片等不同层次靶标筛选所筛选出的功能核酸的表征技术平台；构建DNA/ RNA文库、人工碱基文库、核酸化学修饰文库；服务于肿瘤等疾病标志物的发现和分子探针的研制。
2.液体活检技术平台：
聚焦循环肿瘤细胞、外泌体、循环DNA等肿瘤液体活检技术，建立血清、尿液等不同体液样品的分离和处理方法；开发基于核酸适体探针的微流控、热泳富集、无分离荧光偏振检测等的分析技术；推进临床试验，服务于分子诊断、分子病理以及重大疾病预防的研究。
3.纳米医学技术平台：
医学诊断和治疗相关纳米材料研发及规模化制备技术：包括荧光纳米颗粒、磁性纳米颗粒、多模态纳米颗粒等；纳米药物的制备和评价：包括功能核酸药物载体理化性质、药物靶向性、吸收速率、刺激响应性、生物相容性、可降解性等；纳米成像技术平台的构建：包括超分辨成像、扫描探针显微成像、电子显微镜成像等。
4.转化医学研究平台：
建立在基础研究与临床应用之间的转化通道，凝练临床实践中的科学问题，提供临床数据和样本，比较动物实验与人体临床研究的差异；服务于分子医学院以及杭州高等研究院其他学院的相关研究，促进临床应用和基础研究成果之间快速的双向转化
